Chondroïtinesulfaat is niet alleen de bouwsteen van de veel grotere moleculen hyaluronzuur (HA) en proteoglycaan (PG), het remt ook de effecten van verschillende enzymen die kraakbeen afbreken. Onderzoek heeft aangetoond dat chondroïtinesulfaat biologisch beschikbaar is in het paard en dat het synergetisch lijkt te werken met glucosamine bij de aanmaak van nieuw kraakbeen en het remmen van de afbraak van kraakbeen.